Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY3Q7L099 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY3Q7L099 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms