Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCD1Q6ZMY3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms