Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4L3Q6VB84 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4L3Q6VB84 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms