Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms