Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA5Q6Q788 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA5Q6Q788 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms