Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC137Q6PK04 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms