Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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CSAG1Q6PB30 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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CSAG1Q6PB30 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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CSAG1Q6PB30 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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CSAG1Q6PB30 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSAG1Q6PB30 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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