Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6P435 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6P435 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6P435 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6P435 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms