Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC41PQ6P2S7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC41PQ6P2S7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC41PQ6P2S7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC41PQ6P2S7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC41PQ6P2S7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms