Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAAP20Q6NZ36 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms