Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40BQ6NWY9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms