Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L3Q68CJ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms