Protein–RNA interactions for Protein: Q5W188

CST9LP1, Putative cystatin-9-like protein CST9LP1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9LP1Q5W188 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CST9LP1Q5W188 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms