Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD4Q5VX71 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms