Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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LRRC38Q5VT99 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC38Q5VT99 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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