Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERC4Q5GLZ8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms