Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM41BQ5BJD5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms