Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC93Q567U6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms