Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRFIP1Q32MZ4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRFIP1Q32MZ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms