Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CEACAM16Q2WEN9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEACAM16Q2WEN9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms