Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL40Q2TBA0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms