Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT24Q2M2I5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT24Q2M2I5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms