Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms