Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms