Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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