Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME3Q16798 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ME3Q16798 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME3Q16798 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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