Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLPPQ16740 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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