Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECM1Q16610 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECM1Q16610 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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