Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TCEA2Q15560 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TCEA2Q15560 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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