Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCOLCEQ15113 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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