Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCAPHQ15003 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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