Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SQLEQ14534 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SQLEQ14534 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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