Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RBM39Q14498 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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RBM39Q14498 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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