Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCARB2Q14108 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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