Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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