Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL4AQ13619 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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