Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR3Q13615 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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