Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNW1Q13573 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNW1Q13573 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNW1Q13573 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms