Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEUROD1Q13562 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms