Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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PTK7Q13308 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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PTK7Q13308 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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PTK7Q13308 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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PTK7Q13308 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTK7Q13308 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms