Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1AQ13111 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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