Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPS1Q13098 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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