Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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