Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFX1Q12986 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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