Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXC1Q12948 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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