Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD47Q08722 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD47Q08722 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms