Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4CQ08493 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4CQ08493 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms