Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GABPB1Q06547 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABPB1Q06547 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms