Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNB3Q05901 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms