Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms